STR
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點(diǎn)擊量:發(fā)布時(shí)間:2019-12-01 15:14:25文章來(lái)源:未知
一、 STR檢測(cè)介紹
STR是短串聯(lián)重復(fù)序列,也叫微衛(wèi)星序列。是由2-6個(gè)堿基n次重復(fù)形成的具有高度多態(tài)性的序列。廣泛應(yīng)用于法醫(yī)領(lǐng)域的身份識(shí)別和親權(quán)鑒定、遺傳病的輔助診斷。
ICLAC(國(guó)際細(xì)胞鑒定委員會(huì))于2012年成立,推薦STR檢測(cè)用于人源細(xì)胞系的身份鑒定,并制定了相應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn): Standardization of STR Pro?ling (ASN-0002-2011)。該委員會(huì)的成立,目的就是推動(dòng)醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域?qū)?strong>細(xì)胞系的錯(cuò)誤識(shí)別和交叉污染問(wèn)題的深刻認(rèn)識(shí),并將細(xì)胞系的身份認(rèn)證作為有效的方法來(lái)減少和防止細(xì)胞系的錯(cuò)誤識(shí)別,交叉污染。
二、 細(xì)胞STR檢測(cè)身份認(rèn)證的背景
2.1 ICLAC統(tǒng)計(jì)并發(fā)布了截止2018.10.14日細(xì)胞錯(cuò)誤識(shí)別的信息目錄,共計(jì)529株細(xì)胞,其中486株細(xì)胞,已無(wú)法找到真實(shí)的原始樣本;43株細(xì)胞原先被發(fā)現(xiàn)是錯(cuò)誤識(shí)別的,現(xiàn)已經(jīng)找到了原始的真實(shí)樣本;60株細(xì)胞與原供體不一致,但污染物未知;54株細(xì)胞種屬來(lái)源不一致;有149個(gè)污染物,最常見的是Hela,其次是T-24,M14。
(ICLAC已公布的細(xì)胞污染列表可聯(lián)系hgene@126.com索取)
2.2 關(guān)于細(xì)胞系錯(cuò)誤認(rèn)證的參考文獻(xiàn)
三、細(xì)胞STR鑒定的意義
3.1 為科研界的細(xì)胞驗(yàn)明正身,避免因"張冠李戴”而不自知造成的損失。
在所有醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域,對(duì)于細(xì)胞系的使用是在普遍不過(guò)的。然而由于細(xì)胞系的質(zhì)控在發(fā)展的過(guò)程中,并沒(méi)有一開始得到重視。只是在往后的科學(xué)研究中,不斷發(fā)現(xiàn)用同樣的細(xì)胞系,做同樣的實(shí)驗(yàn),結(jié)果無(wú)法重現(xiàn)或者結(jié)果千差萬(wàn)別。細(xì)胞形態(tài)明明與胃來(lái)源相似,經(jīng)鑒定確是肝細(xì)胞系。甚至發(fā)現(xiàn)明明是人的細(xì)胞,經(jīng)鑒定卻變成了小鼠或者大鼠細(xì)胞。如此這樣的“張冠李戴”現(xiàn)象,在全世界不同實(shí)驗(yàn)室不斷上演。
所幸國(guó)際細(xì)胞鑒定委員會(huì)(ICLAC)這樣一個(gè)組織的成立,將為科研界使用的細(xì)胞系,帶來(lái)驗(yàn)明真身的機(jī)會(huì)。我們可以看到國(guó)際上各大細(xì)胞庫(kù)(包括ATCC,DSMZ,JCRB,ECACC,KCLB,CBA,COG等)已經(jīng)對(duì)庫(kù)里的細(xì)胞進(jìn)行了一個(gè)叫做STR鑒定的工作,為存儲(chǔ)的細(xì)胞獲取了身份標(biāo)簽。并以此為依據(jù),對(duì)這些細(xì)胞系的子代細(xì)胞進(jìn)行溯源身份質(zhì)控和交叉污染監(jiān)控。于此同時(shí),Scinece,Nature,cell等國(guó)際權(quán)威雜志及其子刊也呼吁并要求
欲發(fā)表的論文,需要對(duì)研究所涉及的細(xì)胞進(jìn)行鑒定,以確保所用細(xì)胞沒(méi)有問(wèn)題。
3.2 使用正確的細(xì)胞系,讓科研結(jié)果更真實(shí),也讓同行能夠有機(jī)會(huì)互相驗(yàn)證結(jié)果。
3.3 為胞的身份溯源,找到了原始的依據(jù)(細(xì)胞的STR數(shù)據(jù))。
然而即便如此,細(xì)胞的真實(shí)身份的鑒定問(wèn)題,仍然面臨不小的挑戰(zhàn)。這需要科研界和相關(guān)領(lǐng)域同仁共同的努力。只有提高認(rèn)識(shí),并嚴(yán)肅認(rèn)真對(duì)待。方能還我們使用的細(xì)胞一個(gè)公道。
STR是短串聯(lián)重復(fù)序列,也叫微衛(wèi)星序列。是由2-6個(gè)堿基n次重復(fù)形成的具有高度多態(tài)性的序列。廣泛應(yīng)用于法醫(yī)領(lǐng)域的身份識(shí)別和親權(quán)鑒定、遺傳病的輔助診斷。
ICLAC(國(guó)際細(xì)胞鑒定委員會(huì))于2012年成立,推薦STR檢測(cè)用于人源細(xì)胞系的身份鑒定,并制定了相應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn): Standardization of STR Pro?ling (ASN-0002-2011)。該委員會(huì)的成立,目的就是推動(dòng)醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域?qū)?strong>細(xì)胞系的錯(cuò)誤識(shí)別和交叉污染問(wèn)題的深刻認(rèn)識(shí),并將細(xì)胞系的身份認(rèn)證作為有效的方法來(lái)減少和防止細(xì)胞系的錯(cuò)誤識(shí)別,交叉污染。
二、 細(xì)胞STR檢測(cè)身份認(rèn)證的背景
2.1 ICLAC統(tǒng)計(jì)并發(fā)布了截止2018.10.14日細(xì)胞錯(cuò)誤識(shí)別的信息目錄,共計(jì)529株細(xì)胞,其中486株細(xì)胞,已無(wú)法找到真實(shí)的原始樣本;43株細(xì)胞原先被發(fā)現(xiàn)是錯(cuò)誤識(shí)別的,現(xiàn)已經(jīng)找到了原始的真實(shí)樣本;60株細(xì)胞與原供體不一致,但污染物未知;54株細(xì)胞種屬來(lái)源不一致;有149個(gè)污染物,最常見的是Hela,其次是T-24,M14。
(ICLAC已公布的細(xì)胞污染列表可聯(lián)系hgene@126.com索取)
2.2 關(guān)于細(xì)胞系錯(cuò)誤認(rèn)證的參考文獻(xiàn)
| 文章名稱 | 發(fā)表雜志及時(shí)間 |
| Cell-line authentication: End the scandal of false cell lines | Nature 492: 186,2012 |
| Cell line misidentification: the beginning of the end | Nat Rev Cancer. 2010 Jun |
| Check your cultures! A list of cross-contaminated or misidentified cell lines |
Int J Cancer, 21 April 2010 |
| False and mycoplasma contaminated leukemia-lymphoma cell lines: time for a reappraisal |
Int J Cancer, 2017 |
| Reproducibility: changing the policies and culture of cell line authentication |
Nature Methods ,2015.5.28 |
| The ghosts of HeLa: How cell line misidentification contaminates the scientific literature |
PLoS One. 2017 Oct 12 |
| DNA profiling analysis of endometrial and ovarian cell lines reveals misidentification, redundancy and contamination |
Gynecol Oncol. 2012 Oct |
| Human cell line authentication: the critical first step in any project using human cell lines |
Methods Mol Biol. 2013 |
三、細(xì)胞STR鑒定的意義
3.1 為科研界的細(xì)胞驗(yàn)明正身,避免因"張冠李戴”而不自知造成的損失。
在所有醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域,對(duì)于細(xì)胞系的使用是在普遍不過(guò)的。然而由于細(xì)胞系的質(zhì)控在發(fā)展的過(guò)程中,并沒(méi)有一開始得到重視。只是在往后的科學(xué)研究中,不斷發(fā)現(xiàn)用同樣的細(xì)胞系,做同樣的實(shí)驗(yàn),結(jié)果無(wú)法重現(xiàn)或者結(jié)果千差萬(wàn)別。細(xì)胞形態(tài)明明與胃來(lái)源相似,經(jīng)鑒定確是肝細(xì)胞系。甚至發(fā)現(xiàn)明明是人的細(xì)胞,經(jīng)鑒定卻變成了小鼠或者大鼠細(xì)胞。如此這樣的“張冠李戴”現(xiàn)象,在全世界不同實(shí)驗(yàn)室不斷上演。
所幸國(guó)際細(xì)胞鑒定委員會(huì)(ICLAC)這樣一個(gè)組織的成立,將為科研界使用的細(xì)胞系,帶來(lái)驗(yàn)明真身的機(jī)會(huì)。我們可以看到國(guó)際上各大細(xì)胞庫(kù)(包括ATCC,DSMZ,JCRB,ECACC,KCLB,CBA,COG等)已經(jīng)對(duì)庫(kù)里的細(xì)胞進(jìn)行了一個(gè)叫做STR鑒定的工作,為存儲(chǔ)的細(xì)胞獲取了身份標(biāo)簽。并以此為依據(jù),對(duì)這些細(xì)胞系的子代細(xì)胞進(jìn)行溯源身份質(zhì)控和交叉污染監(jiān)控。于此同時(shí),Scinece,Nature,cell等國(guó)際權(quán)威雜志及其子刊也呼吁并要求
欲發(fā)表的論文,需要對(duì)研究所涉及的細(xì)胞進(jìn)行鑒定,以確保所用細(xì)胞沒(méi)有問(wèn)題。
3.2 使用正確的細(xì)胞系,讓科研結(jié)果更真實(shí),也讓同行能夠有機(jī)會(huì)互相驗(yàn)證結(jié)果。
3.3 為胞的身份溯源,找到了原始的依據(jù)(細(xì)胞的STR數(shù)據(jù))。
然而即便如此,細(xì)胞的真實(shí)身份的鑒定問(wèn)題,仍然面臨不小的挑戰(zhàn)。這需要科研界和相關(guān)領(lǐng)域同仁共同的努力。只有提高認(rèn)識(shí),并嚴(yán)肅認(rèn)真對(duì)待。方能還我們使用的細(xì)胞一個(gè)公道。


